Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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