Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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