Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apba1B2RUJ5 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms