Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm4787B2RUD9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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