Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms