Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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