Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms