Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H60cB1B213 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
H60cB1B213 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H60cB1B213 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H60cB1B213 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms