Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms