Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms