Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms