Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms