Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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