Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syngr4Q9Z1L2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms