Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Nme3Q9WV85 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Nme3Q9WV85 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Nme3Q9WV85 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Nme3Q9WV85 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms