Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sema6cQ9WTM3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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