Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc2lQ9JME7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms