Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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