Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms