Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms