Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm37309-201ENSMUST00000194994 1639 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Prl3a1-201ENSMUST00000049463 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms