Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms