Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4bQ9D8B3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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