Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpn3Q9D3W4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms