Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms