Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snf8Q9CZ28 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms