Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms