Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms