Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Rpl39lQ9CQD0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Rpl39lQ9CQD0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Rpl39lQ9CQD0 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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