Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atg3Q9CPX6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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