Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ms4a4dQ99N05 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms