Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp16Q99LG0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp16Q99LG0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp16Q99LG0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp16Q99LG0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp16Q99LG0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp16Q99LG0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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