Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Pacsin3Q99JB8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Pacsin3Q99JB8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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