Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms