Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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