Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms