Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh10Q8VCH7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh10Q8VCH7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms