Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms