Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms