Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SrrdQ8K2M3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SrrdQ8K2M3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SrrdQ8K2M3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SrrdQ8K2M3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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