Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms