Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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