Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh13Q8CEE7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms