Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms