Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Nhlrc3Q8CCH2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Nhlrc3Q8CCH2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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