Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc113Q8C5T8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc113Q8C5T8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc113Q8C5T8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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