Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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