Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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