Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp398Q8BV16 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms