Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tspan12Q8BKT6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan12Q8BKT6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms